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- Echinocereus caespitosus var. adustus (Engelm. in Wisliz.) Borg
- Echinocereus caespitosus var. armatus (Poselg. ex Engelm.) Borg
- Echinocereus caespitosus var. castaneus (Engelm.) Rümpler in Förster
- Echinocereus caespitosus f. castaneus (Engelm.) Borg
- Echinocereus caespitosus var. chrysacanthus (K.Schum.) Borg
- Echinocereus caespitosus var. major (Engelm.) Rümpler in C.F.Först.
- Echinocereus caespitosus var. minor (Engelm.)
- Echinocereus caespitosus var. purpureus (Lahman) D.Weniger
- Echinocereus caespitosus var. reichenbachii (Terscheck ex Walp.) Borg
- Echinocereus caespitosus var. rufispinus (Engelm. ex Wisliz.) Borg
- Echinocereus canyonensis Clover & Jotter
- Echinocereus carmenensis W.Blum, Mich.Lange & E.Scherer in W.Blum et al.
- Echinocereus carnosus Rümpler
- Echinocereus castaneus (Engelm.) Orcutt
- Echinocereus cernosus Frič
- Echinocereus chiloensis (Colla) Console & Lem.
- Echinocereus chisoensis W.T.Marshall
- Echinocereus chisoensis var. fobeanus (Oehme) N.P.Taylor
- Echinocereus chisosensis subs. fobeanus (Oehme) N.P.Taylor
- Echinocereus chloranthus (Engelm.) Engelm. ex Rümpler in Förster
- Echinocereus chloranthus subs. cylindricus (Engelm.) W.Blum & Mich.Lange in W.Blum et al.
- Echinocereus chloranthus subs. cylindricus f. corellii (L.D.Benson)
- Echinocereus chloranthus var. cylindricus (Engelm.) N.P.Taylor
- Echinocereus chloranthus var. livermorensis Kolle
- Echinocereus chloranthus var. neocapillus D.Weniger
- Echinocereus chloranthus subs. rhyolithensis W.Blum & Mich.Lange in W.Blum et al.
- Echinocereus chloranthus var. russanthus (D.Weniger) J.G.Lamb. ex G.D.Rowley
- Echinocereus chloranthus subs. weedinii hort.
- Echinocereus chlorophthalmus (Hook.) Britton & Rose
- Echinocereus chrysocentrus (Engelm. & J.M.Bigelow) Orcutt
- Echinocereus chrysocentrus var. purpureus (L.D.Benson) hort.
- Echinocereus cinerascens (DC.) Lem.
- Echinocereus cinerascens var. crassior (DC.)
- Echinocereus cinerascens subs. ehrenbergii (Pfeiff.) W.Blum & Rutow
- Echinocereus cinerascens var. ehrenbergii (Pfeiff.) Bravo
- Echinocereus cinerascens var. fendleri (Bois)
- Echinocereus cinerascens subs. septentrionalis (N.P.Taylor) N.P.Taylor
- Echinocereus cinerascens var. septentrionalis N.P.Taylor
- Echinocereus cinerascens var. tenuior (DC.)
- Echinocereus cinerascens subs. tulensis (Bravo) N.P.Taylor
- Echinocereus cinerascens var. tulensis (Bravo) N.P.Taylor
- Echinocereus cinnabarinus (Hook.) K.Schum.
- Echinocereus cirrhiferus (Labour.) J.N.Haage
- Echinocereus coccineus Engelm. in Wisliz.
- Echinocereus coccineus subs. aggregatus (Engelm. ex S.Watson) W.Blum, Mich.Lange & Rutow
- Echinocereus coccineus var. arizonicus (Rose ex Orcutt) D.J.Ferguson
- Echinocereus coccineus var. gurneyi (L.D.Benson) S.Brack & K.D.Heil
- Echinocereus coccineus var. inermis (K.Schum.) J.A.Purpus
- Echinocereus coccineus var. kunzei (Gürke) Backeb.
- Echinocereus coccineus subs. mojavensis (Engelm. & J.M.Bigelow) N.P.Taylor
- Echinocereus coccineus var. octacanthus (Muehlenpf.) Boissev.
- Echinocereus coccineus subs. paucispinus (Engelm.) W.Blum, Mich.Lange & Rutow in W.Blum et al.
- Echinocereus coccineus var. paucispinus (Engelm.) D.J.Ferguson
- Echinocereus coccineus var. rosei (Wooton & Standl.) A.D.Zimmerman
- Echinocereus conglomeratus C.F.Först. ex K.Schum.
- Echinocereus conoideus (Engelm.) Rümpler
- Echinocereus correllii Kuenzler
- Echinocereus cowperii n.n.
- Echinocereus ctenoides (Engelm.) Rümpler in C.F.Först.
- Echinocereus cucumis Werderm.
- Echinocereus dasyacanthus Engelm.
- Echinocereus dasyacanthus var. ctenoides (Engelm.) Backeb.
- Echinocereus dasyacanthus subs. rectispinus (Trocha & Fethke) W.Blum, W.Rischer & Rutow
- Echinocereus dasyacanthus var. rectispinus Trocha & Fethke
- Echinocereus dasyacanthus var. rigidissimus (Engelm.) W.T.Marshall
- Echinocereus davisii Houghton
- Echinocereus davisii f. brevispinus hort.
- Echinocereus decumbens Clover & Jotter
- Echinocereus deflexispinus (Monv. ex Labour.)
- Echinocereus delaetii (Gürke) Gürke
- Echinocereus delaetii var. freudenbergeri (G.Frank) N.P.Taylor
- Echinocereus deppei (Pfeiff.)
- Echinocereus dubius (Engelm.) Engelm. in C.F.Först.
- Echinocereus durangensis Rümpler ex Förster
- Echinocereus ehrenbergii (Pfeiff.) Rümpler in C.F.Först.
- Echinocereus emoryi Rümpler
- Echinocereus engelmannii (Parry ex Engelm.) Lem.
- Echinocereus engelmannii (Parry ex Engelm.) Rümpler in C.F.Först.
- Echinocereus engelmannii var. acicularis L.D.Benson in L.D.Benson
- Echinocereus engelmannii var. armatus L.D.Benson
- Echinocereus engelmannii var. chrysocentrus (Engelm. & J.M.Bigelow) Rümpler in C.F.Först.
- Echinocereus engelmannii subs. decumbens (Clover & Jotter) W.Blum & Mich.Lange in W.Blum et al.
- Echinocereus engelmannii var. decumbens (Clover & Jotter) L.D.Benson
- Echinocereus engelmannii subs. fasciculatus (Engelm. ex S.Watson) W.Blum & Mich.Lange
- Echinocereus engelmannii var. howei L.D.Benson
- Echinocereus engelmannii subs. llanuraensis (Rutow) Felger
- Echinocereus engelmannii var. munzii (Parish) W.Pierce & Fosberg
- Echinocereus engelmannii var. nicholii L.D.Benson
- Echinocereus engelmannii var. purpureus L.D.Benson
- Echinocereus engelmannii subs. variegatus (Engelm. & J.M.Bigelow) E. Lutz
- Echinocereus engelmannii var. variegatus (Engelm. & J.M.Bigelow) Rümpler in C.F.Först.
- Echinocereus enneacanthus Engelm. in Wisliz.
- Echinocereus enneacanthus subs. brevispinus (W.O.Moore) N.P.Taylor
- Echinocereus enneacanthus var. brevispinus (W.O.Moore) L.D.Benson
- Echinocereus enneacanthus f. brevispinus W.O.Moore
- Echinocereus enneacanthus var. carnosus (Rümpler) Quehl
- Echinocereus enneacanthus var. conglomeratus (C.F.Först. ex K.Schum.) L.D.Benson
- Echinocereus enneacanthus f. cristata hort.
- Echinocereus enneacanthus var. dubius (Engelm.) L.D.Benson
- Echinocereus enneacanthus f. intermedius W.O.Moore